Muzeum najdete v prostorách bývalé výtopny společnosti Buštěhradská dráha. Tehdejší výtopna Lužná – Lišany patřila do sítě základen pro provozní ošetření lokomotiv. S postupem doby a nástupem motorových lokomotiv se snížil význam depa a nakonec jej železničáři v polovině devadesátých let přestali využívat.
Vyklizené depo však neuniklo pozornosti fandů železniční nostalgie.
Proto se krátce po zastavení železničního provozu začali do prázdného areálu stěhovat členové různých spolků, kteří začali koleje depa plnit lokomotivami a vozy v různém stavu. V roce 1997 zde zahájil činnost spolek zabývající se historií železnic.
V červenci roku 1999 převzaly provoz muzea České dráhy. Exponáty tvoří převážně parní lokomotivy, osobní a nákladní vozy z různých období a v krytých expozicích spatříte nejrůznější předměty z historie železnic.
